“一體化管理”是指在縣級衛生行政部門統一規劃和組織實施下，以鄉鎮為範圍，對鄉鎮衛生院和村衛生室的行政、業務、藥械、財務和績效考核“五統一”的管理體制。在“一體化管理”中，鄉鎮衛生管理辦公室和鄉鎮衛生院受縣級衛生行政部門的委託，負責履行本轄區內衛生管理職責，在向農民提供公共衛生服務和常見病、多發病的診療等綜合服務的同時，承擔對村衛生室的管理和指導職能。村衛生室承擔行政村的公共衛生服務及一般疾病的初級診治等工作。
一、村衛生室人事管理制度
1．由鄉鎮衛生院負責統一聘用村衛生室從業人員，並與鄉村醫生簽訂聘用合同書，原則上一年一聘。
2．村衛生室人員必須具備執業（助理）醫師、鄉村醫生、護士等法定從業資格，規範執業，不得開展執業範圍以外的診療活動。
3．村衛生室受聘的執業人員必須定期接受崗位培訓，每年接受培訓不得少於2 次。
4．嚴格執行鄉村醫生每月到鄉鎮衛生院上一週班或一週上一天班工作制度。
5．培訓制度將與考核考試製度結合到一起，作為確定執業資格和續聘的依據。
二、村衛生室業務管理制度
1．統一公共衛生服務。鄉鎮衛生院對轄區公共衛生工作負總責，對村衛生室基本公共衛生服務進行檢查指導和考核。
2．規範基本醫療服務。建立健全村衛生室的規章制度和業務技術流程，醫療文書統一規範，加強服務質量管理，預防醫療差錯和事故，健全傳染病登記報告制度，確保醫療服務安全。
3．提高衛生服務水平。鄉鎮衛生院應採取工作例會、病例討論、業務培訓等多種方式，加強對村衛生室的技術指導和管理指導。鄉鎮衛生院與村衛生室要建立雙向轉診機制，確保急救網路高效暢通，採取各種有效措施方便群眾就醫。
4．增強網路資訊效率。衛生院要加快村衛生室的資訊化建設步伐，建立健康檔案、急救平臺、基本藥物使用、基本診療服務、公共衛生服務、鄉村醫生培訓、績效考核等內容為一體的鄉村衛生服務網路資訊系統，提高管理效率。
三、村衛生室藥械管理制度
1．積極推行國家基本藥物制度。村衛生室全部配備使用國家基本藥物目錄內藥品，在相關補償政策保障下，推行藥品零差率銷售。
2．建立藥品登記管理制度。村衛生室應建立規範科學的藥品臺賬，村衛生室實行基本藥物統一採購、統一價格、統一配送，切實加強藥品購銷、儲存、銷售、使用管理。
3．建立藥品監督管理制度。鄉鎮衛生院對村衛生室的基本藥物用藥情況進行監督管理，村衛生室在鄉鎮衛生院的組織下，接受以縣為單位統一招標的藥品配送企業的配送服務，嚴禁擅自從其他渠道購進藥品。
4．建立醫療器械登記制度。政府配備給村衛生室的所有醫療器械，由所在地的鄉鎮衛生院統一驗收入庫，實行固定資產登記，並及時分發到村衛生室投入使用。村衛生室應確定人員加強器械管理，保證醫療器械處於正常功能狀態。
四、村衛生室財務管理制度
1．鄉衛生院對村衛生室收支實行統一管理，獨立核算，自負盈虧。
2．衛生院對各村衛生室設定總帳、收支明細帳、財產物資明細帳，衛生室設現金日記帳。
3．統一執行國家規定的收費標準，衛生室不得擅自變更。
4．村衛生室的收入分為醫療收入、藥品收入、其他收入，體檢、婦幼保健等衛生服務收入納入醫療收入核算。
5．村衛生室的支出分為：人員工資、獎金、藥品器材、公用費、培訓費等。
五、鄉村醫生績效考核制度
1．鄉鎮衛生院健全鄉村醫生績效考核制度，主要考核國家基本和重大公共衛生服務專案的落實和基本醫療服務，國家基本藥物的使用，藥品零差率銷售，中醫適宜技術應用和群眾滿意度等內容。
2．鄉鎮衛生院按照《莊浪縣村衛生室績效考核主要指標及分值表》，通過查閱資料、實地檢視、現場問卷調查等方式，於每年6月上旬、12月上旬對村衛生室的工作進行兩次集會考核，年度成績取綜合考核分值。考核時，按標準要求扣分，所有專案以本項分值為底線，扣完為止，不倒扣分。
3．考核結果：考核結果分為四個等次：分值85分以上為優秀，70—84分為良好，60—69分為合格，60分以下為不合格。
4．村衛生室年度考核不合格的，按照《莊浪縣基層醫療機構績效考核辦法》扣減補助標準，責令限期整改，連續兩年考核不合格的，取消一體化管理機構服務資格。
六、督導反饋制度
1．鄉鎮衛生院負責對轄區村衛生室的督導管理。鄉衛生院督導工作時，檢查督導過程中發現的問題以及提出的整改意見要有文字記錄，並由衛生室負責人簽字確認。
2．各衛生室配備1本工作手冊，專供接受檢查督導時使用，記錄的內容包括日期、參加人員、發現的問題、提出的整改意見以及整改落實情況。
3．鄉衛生院對轄區內所有衛生室的督導每月不少於1次，對存在問題較多的衛生室要加大督導力度，增加督導頻次。督導記錄作為考核鄉衛生院對衛生室督導和管理的依據。